Chương trình đại học

• Trường Khoa học Chính trị và Kinh tế
• Trường Luật
• Trường Văn hoá, Truyền thông và Xã hội
• Trường Nhân văn và Khoa học Xã hội
• Trường Giáo dục
• Trường Thương mại
• Trường Khoa học và Kỹ thuật căn bản
• Trường Khoa học và Kỹ thuật sáng tạo
• Trường Khoa học và Kỹ thuật cao cấp
• Trường Khoa học Xã hội
• Trường Khoa học Con người
• Trường Khoa học Thể thao
• Trường Nghiên cứu Tự do Quốc tế

Chương trình sau đại học

• Trường cao học Khoa học Chính trị
• Trường cao học Kinh tế
• Trường cao học Luật
• Trường cao học Văn chương và Khoa học
• Trường cao học Thương mại
• Trường cao học Khoa học và Kỹ thuật căn bản
• Trường cao học Khoa học và Kỹ thuật sáng tạo
• Trường cao học Khoa học và Kỹ thuật cao cấp
• Trường cao học Giáo dục
• Trường cao học Khoa học Con người
• Trường cao học Khoa học Xã hội
• Trường cao học Nghiên cứu Châu Á-Thái Bình Dương
• Trường cao học Nghiên cứu Thông tin và Viễn thông Toàn cầu
• Trường cao học Ngôn ngữ học Ứng dụng Nhật Bản
• Trường cao học Thông tin, Sản xuất và Hệ thống
• Trường cao học Khoa học Thể thao
• Trường Kinh tế
• Trường Quản trị công Okuma
• Trường Luật
• Trường cao học Tài chính, Kế toán và Luật
• Trường cao học Kế toán
• Trường cao học Môi trường và Năng lượng
• Trường cao học Báo chí

Viện nghiên cứu

• Phòng thí nghiệm Khoa học và Công nghệ Vật liệu Kagami
• Viện Luật So Sánh
• Viện Nghiên cứu Quản trị Kinh doanh
• Viện Nghiên cứu về các vấn đề Chính trị và Kinh tế đương đại
• Trung tâm nghiên cứu cao cấp về Khoa học Con người
• Viện Nghiên cứu cao cấp về Khoa học và Kỹ thuật
• Viện Nghiên cứu Châu Á-Thái Bình Dương
• Global Information and Telecommunication Institute
• Viện Viễn thông và Thông tin Toàn cầu
• Trung tâm tiếng Nhật
• Trung tâm Mạng Truyền thông
• Viện Nghiên cứu Môi trường
• Trung tâm An toàn Môi trường
• Trung tâm Nghiên cứu Tài chính
• Trung tâm Dịch vụ Con người
• Tổ chức Nghiên cứu toàn diện (Viện Nghiên cứu Dự án)
• Viện Khoa học Nano & Công nghệ Nano
• Viện Nghiên cứu hợp nhất về Khoa học và Y tế cao cấp
• Tổ chức Nghiên cứu Công nghệ Thông tin
• Tổ chức Nghiên cứu Châu Á
• Viện Nghiên cứu cao cấp Waseda (WIAS)